Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6G3

NECAB2, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB2Q7Z6G3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NECAB2Q7Z6G3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NECAB2Q7Z6G3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NECAB2Q7Z6G3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NECAB2Q7Z6G3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NECAB2Q7Z6G3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NECAB2Q7Z6G3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NECAB2Q7Z6G3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NECAB2Q7Z6G3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NECAB2Q7Z6G3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NECAB2Q7Z6G3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NECAB2Q7Z6G3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NECAB2Q7Z6G3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NECAB2Q7Z6G3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NECAB2Q7Z6G3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NECAB2Q7Z6G3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NECAB2Q7Z6G3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NECAB2Q7Z6G3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NECAB2Q7Z6G3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NECAB2Q7Z6G3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NECAB2Q7Z6G3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms