Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
APTXQ7Z2E3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
APTXQ7Z2E3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
APTXQ7Z2E3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APTXQ7Z2E3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APTXQ7Z2E3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms