Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
OTOP1Q7RTM1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
OTOP1Q7RTM1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
OTOP1Q7RTM1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
OTOP1Q7RTM1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
OTOP1Q7RTM1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms