Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GDPD3Q7L5L3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD3Q7L5L3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GDPD3Q7L5L3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GDPD3Q7L5L3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms