Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVX7

NCCRP1, F-box only protein 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCCRP1Q6ZVX7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCCRP1Q6ZVX7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCCRP1Q6ZVX7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCCRP1Q6ZVX7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCCRP1Q6ZVX7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCCRP1Q6ZVX7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NCCRP1Q6ZVX7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NCCRP1Q6ZVX7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms