Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC149Q6ZUS6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC149Q6ZUS6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC149Q6ZUS6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms