Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RBM43Q6ZSC3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RBM43Q6ZSC3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RBM43Q6ZSC3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RBM43Q6ZSC3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RBM43Q6ZSC3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms