Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf47Q6ZRZ4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C9orf47Q6ZRZ4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
C9orf47Q6ZRZ4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
C9orf47Q6ZRZ4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms