Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP01

RBM44, RNA-binding protein 44, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM44Q6ZP01 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RBM44Q6ZP01 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RBM44Q6ZP01 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RBM44Q6ZP01 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBM44Q6ZP01 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms