Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CASC2Q6XLA1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CASC2Q6XLA1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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