Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCBE1Q6UXH8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCBE1Q6UXH8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCBE1Q6UXH8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCBE1Q6UXH8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms