Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCSK4Q6UW60 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCSK4Q6UW60 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCSK4Q6UW60 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms