Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC137Q6PK04 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC137Q6PK04 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCDC137Q6PK04 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC137Q6PK04 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC137Q6PK04 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC137Q6PK04 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms