Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ULK3Q6PHR2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ULK3Q6PHR2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ULK3Q6PHR2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ULK3Q6PHR2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms