Protein–RNA interactions for Protein: Q6P499

NIPAL3, NIPA-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL3Q6P499 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NIPAL3Q6P499 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NIPAL3Q6P499 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIPAL3Q6P499 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NIPAL3Q6P499 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPAL3Q6P499 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPAL3Q6P499 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPAL3Q6P499 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NIPAL3Q6P499 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL3Q6P499 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL3Q6P499 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL3Q6P499 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL3Q6P499 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL3Q6P499 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL3Q6P499 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL3Q6P499 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL3Q6P499 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NIPAL3Q6P499 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms