Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NANOGP8Q6NSW7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NANOGP8Q6NSW7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NANOGP8Q6NSW7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms