Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SAMD13Q5VXD3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SAMD13Q5VXD3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD13Q5VXD3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms