Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVQ6

YOD1, Ubiquitin thioesterase OTU1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YOD1Q5VVQ6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
YOD1Q5VVQ6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
YOD1Q5VVQ6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
YOD1Q5VVQ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
YOD1Q5VVQ6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms