Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C1orf53Q5VUE5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C1orf53Q5VUE5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C1orf53Q5VUE5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
C1orf53Q5VUE5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C1orf53Q5VUE5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C1orf53Q5VUE5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C1orf53Q5VUE5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C1orf53Q5VUE5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C1orf53Q5VUE5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C1orf53Q5VUE5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C1orf53Q5VUE5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C1orf53Q5VUE5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C1orf53Q5VUE5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C1orf53Q5VUE5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C1orf53Q5VUE5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C1orf53Q5VUE5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C1orf53Q5VUE5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
C1orf53Q5VUE5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms