Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRAMEF20Q5VT98 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRAMEF20Q5VT98 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRAMEF20Q5VT98 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF20Q5VT98 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms