Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCNJQ5T5M9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCNJQ5T5M9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCNJQ5T5M9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNJQ5T5M9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNJQ5T5M9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNJQ5T5M9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCNJQ5T5M9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNJQ5T5M9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCNJQ5T5M9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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