Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBXN11Q5T124 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
UBXN11Q5T124 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBXN11Q5T124 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBXN11Q5T124 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
UBXN11Q5T124 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBXN11Q5T124 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms