Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM1

ZNF678, Zinc finger protein 678, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF678Q5SXM1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF678Q5SXM1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNF678Q5SXM1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF678Q5SXM1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF678Q5SXM1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms