Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SPECC1Q5M775 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SPECC1Q5M775 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SPECC1Q5M775 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SPECC1Q5M775 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SPECC1Q5M775 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms