Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCID2Q5JVF3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCID2Q5JVF3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCID2Q5JVF3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCID2Q5JVF3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCID2Q5JVF3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCID2Q5JVF3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCID2Q5JVF3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCID2Q5JVF3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCID2Q5JVF3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCID2Q5JVF3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCID2Q5JVF3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCID2Q5JVF3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCID2Q5JVF3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCID2Q5JVF3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
PCID2Q5JVF3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms