Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJH7

YIF1B, Protein YIF1B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIF1BQ5BJH7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
YIF1BQ5BJH7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YIF1BQ5BJH7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIF1BQ5BJH7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YIF1BQ5BJH7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.8 ms