Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BRDTQ58F21 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRDTQ58F21 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BRDTQ58F21 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BRDTQ58F21 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms