Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RFTN2Q52LD8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RFTN2Q52LD8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFTN2Q52LD8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RFTN2Q52LD8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms