Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N8

SLC9C1, Sodium/hydrogen exchanger 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C1Q4G0N8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SLC9C1Q4G0N8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SLC9C1Q4G0N8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SLC9C1Q4G0N8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SLC9C1Q4G0N8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms