Protein–RNA interactions for Protein: Q495M9

USH1G, Usher syndrome type-1G protein, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1GQ495M9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
USH1GQ495M9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
USH1GQ495M9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USH1GQ495M9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
USH1GQ495M9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USH1GQ495M9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USH1GQ495M9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USH1GQ495M9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USH1GQ495M9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USH1GQ495M9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USH1GQ495M9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
USH1GQ495M9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USH1GQ495M9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
USH1GQ495M9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms