Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC153Q494R4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC153Q494R4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC153Q494R4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC153Q494R4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC153Q494R4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms