Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI77

KRTAP13-4, Keratin-associated protein 13-4, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-4Q3LI77 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
KRTAP13-4Q3LI77 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP13-4Q3LI77 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms