Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI59

KRTAP21-2, Keratin-associated protein 21-2, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-2Q3LI59 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
KRTAP21-2Q3LI59 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
KRTAP21-2Q3LI59 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms