Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDRF1Q3B7T1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDRF1Q3B7T1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDRF1Q3B7T1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EDRF1Q3B7T1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDRF1Q3B7T1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDRF1Q3B7T1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDRF1Q3B7T1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDRF1Q3B7T1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EDRF1Q3B7T1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDRF1Q3B7T1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDRF1Q3B7T1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDRF1Q3B7T1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EDRF1Q3B7T1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDRF1Q3B7T1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDRF1Q3B7T1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EDRF1Q3B7T1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
EDRF1Q3B7T1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
EDRF1Q3B7T1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
EDRF1Q3B7T1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
EDRF1Q3B7T1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms