Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RFX4Q33E94 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RFX4Q33E94 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RFX4Q33E94 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RFX4Q33E94 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms