Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-BQ31612 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-BQ31612 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HLA-BQ31612 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-BQ31612 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-BQ31612 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms