Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCTN1Q2MV58 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCTN1Q2MV58 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCTN1Q2MV58 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCTN1Q2MV58 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCTN1Q2MV58 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCTN1Q2MV58 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCTN1Q2MV58 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCTN1Q2MV58 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCTN1Q2MV58 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCTN1Q2MV58 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCTN1Q2MV58 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCTN1Q2MV58 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCTN1Q2MV58 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TCTN1Q2MV58 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TCTN1Q2MV58 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TCTN1Q2MV58 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms