Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ISXQ2M1V0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ISXQ2M1V0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ISXQ2M1V0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ISXQ2M1V0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ISXQ2M1V0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms