Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HIF1AQ16665 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HIF1AQ16665 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HIF1AQ16665 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HIF1AQ16665 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HIF1AQ16665 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
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