Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NTRK2Q16620 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NTRK2Q16620 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NTRK2Q16620 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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