Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CARTPTQ16568 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARTPTQ16568 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARTPTQ16568 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARTPTQ16568 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARTPTQ16568 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARTPTQ16568 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARTPTQ16568 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CARTPTQ16568 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARTPTQ16568 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARTPTQ16568 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARTPTQ16568 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARTPTQ16568 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARTPTQ16568 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CARTPTQ16568 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CARTPTQ16568 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CARTPTQ16568 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARTPTQ16568 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms