Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCSK7Q16549 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCSK7Q16549 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCSK7Q16549 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCSK7Q16549 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
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