Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNHIT3Q15649 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNHIT3Q15649 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNHIT3Q15649 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZNHIT3Q15649 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNHIT3Q15649 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNHIT3Q15649 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNHIT3Q15649 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNHIT3Q15649 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNHIT3Q15649 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZNHIT3Q15649 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNHIT3Q15649 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNHIT3Q15649 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNHIT3Q15649 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZNHIT3Q15649 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNHIT3Q15649 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNHIT3Q15649 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZNHIT3Q15649 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNHIT3Q15649 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZNHIT3Q15649 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms