Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNN3Q15417 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CNN3Q15417 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CNN3Q15417 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNN3Q15417 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms