Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PTPAQ15257 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PTPAQ15257 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPAQ15257 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPAQ15257 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPAQ15257 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPAQ15257 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPAQ15257 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPAQ15257 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPAQ15257 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPAQ15257 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPAQ15257 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPAQ15257 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPAQ15257 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPAQ15257 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPAQ15257 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPAQ15257 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPAQ15257 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPAQ15257 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPAQ15257 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
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