Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LAPTM4AQ15012 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LAPTM4AQ15012 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LAPTM4AQ15012 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAPTM4AQ15012 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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