Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NFIXQ14938 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.89■■■□□ 2.7
NFIXQ14938 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NFIXQ14938 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
NFIXQ14938 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NFIXQ14938 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
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