Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPRIN1Q14444 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPRIN1Q14444 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPRIN1Q14444 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAPRIN1Q14444 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
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