Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCARB2Q14108 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCARB2Q14108 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCARB2Q14108 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCARB2Q14108 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms