Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDE7AQ13946 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDE7AQ13946 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE7AQ13946 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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